創(chuàng)建一個(gè)測(cè)試表
postgres=# create table t1(a int);
CREATE TABLE
postgres=# select pg_relation_filepath('t1');
pg_relation_filepath
----------------------
base/75062/75297
(1 row)
postgres=#
在操作系統(tǒng)上已經(jīng)可以看到該文件。
$ ls -la $PGDATA/base/75062/75297
-rw------- 1 postgres postgres 0 Nov 9 11:11 /data/pgdata/11/data/base/75062/75297
插入一些數(shù)據(jù)：
postgres=# show segment_size;
segment_size
--------------
1GB
(1 row)
postgres=# insert into t1 select * from generate_series(1,100000000);
INSERT 0 100000000
postgres=#
因?yàn)閟egment_size的設(shè)置為1GB，磁盤上已經(jīng)有了多個(gè)文件
$ ls -la $PGDATA/base/75062/75297*
-rw------- 1 postgres postgres 1073741824 Nov 9 11:19 /data/pgdata/11/data/base/75062/75297
-rw------- 1 postgres postgres 1073741824 Nov 9 11:17 /data/pgdata/11/data/base/75062/75297.1
-rw------- 1 postgres postgres 1073741824 Nov 9 11:18 /data/pgdata/11/data/base/75062/75297.2
-rw------- 1 postgres postgres 439803904 Nov 9 11:19 /data/pgdata/11/data/base/75062/75297.3
-rw------- 1 postgres postgres 917504 Nov 9 11:18 /data/pgdata/11/data/base/75062/75297_fsm
現(xiàn)在，開啟另一個(gè)會(huì)話(session 2)。
在session2中，啟動(dòng)一個(gè)事務(wù)并創(chuàng)建一個(gè)空表，但是不提交事務(wù)：
postgres=# begin;
BEGIN
postgres=# create table t2(a int);
CREATE TABLE
postgres=# select pg_relation_filepath('t2');
pg_relation_filepath
----------------------
base/75062/75300
(1 row)
postgres=# select * from pg_backend_pid();
pg_backend_pid
----------------
17710
(1 row)
postgres=#
在操作系統(tǒng)已經(jīng)可以看到對(duì)應(yīng)的文件：
$ ls -la $PGDATA/base/75062/75300
-rw------- 1 postgres postgres 0 Nov 9 11:23 /data/pgdata/11/data/base/75062/75300
如果這個(gè)時(shí)候，posrgresql server發(fā)生了奔潰、或者發(fā)生了oom被kill了或者session被kill了。會(huì)發(fā)生什么呢？
我們來模擬一下session被kill的場(chǎng)景：
再次在session2中執(zhí)行查詢：
postgres=# select 1;
server closed the connection unexpectedly
This probably means the server terminated abnormally
before or while processing the request.
The connection to the server was lost. Attempting reset: Succeeded.
postgres=#
這個(gè)session在事務(wù)提交之前被kill了，事務(wù)無法正常完成，但是事務(wù)已經(jīng)創(chuàng)建了一個(gè)表。應(yīng)該發(fā)生什么呢？事務(wù)被回滾，創(chuàng)建的表應(yīng)該不存在了。
postgres=# select * from t2;
ERROR: relation "t2" does not exist
LINE 1: select * from t2;
^
postgres=#
這正是我們所預(yù)期的。但在操作系統(tǒng)上，文件仍然存在：
$ ls -la $PGDATA/base/75062/75300
-rw------- 1 postgres postgres 0 Nov 9 11:23 /data/pgdata/11/data/base/75062/75300
這樣，文件就成了孤兒文件(orphaned file)。
postgresql并不知道這個(gè)文件屬于哪個(gè)relation
postgres=# select relname from pg_class where oid = '75300';
relname
---------
(0 rows)
postgres=#
這樣，你就需要自己手動(dòng)清理孤兒文件了！
假設(shè)你做了大量的數(shù)據(jù)的加載，就在加載完成之前，會(huì)話被殺死:
postgres=# begin;
BEGIN
postgres=# create table t3(a int);
CREATE TABLE
postgres=# select pg_relation_filepath('t3');
pg_relation_filepath
----------------------
base/75062/99528
(1 row)
postgres=# select * from pg_backend_pid();
pg_backend_pid
----------------
21988
(1 row)
postgres=# insert into t3 select * from generate_series(1,1000000000);
server closed the connection unexpectedly
This probably means the server terminated abnormally
before or while processing the request.
The connection to the server was lost. Attempting reset: Failed.
雖然會(huì)話被kill了。但是磁盤上的空間并沒有被釋放。
$ ls -la $PGDATA/base/75062/99528*
-rw------- 1 postgres postgres 1073741824 Nov 9 11:51 /data/pgdata/11/data/base/75062/99528
-rw------- 1 postgres postgres 413777920 Nov 9 11:51 /data/pgdata/11/data/base/75062/99528.1
-rw------- 1 postgres postgres 385024 Nov 9 11:51 /data/pgdata/11/data/base/75062/99528_fsm
在最糟糕的時(shí)候，可能會(huì)占用大量的磁盤空間。那是否有什么方法去檢測(cè)這些孤兒文件呢？
你需要比較postgresql中的目錄表中的記錄和文件系統(tǒng)上信息，然后刪除這些孤兒文件。這個(gè)過程需要小心謹(jǐn)慎。
首先獲得你要檢測(cè)的數(shù)據(jù)庫的oid：
postgres=# select oid from pg_database where datname = 'postgres';
oid
-------
75062
(1 row)
postgres=#
這樣就可以知道文件在文件系統(tǒng)上的位置。即 $PGDATA/base/[OID_OF_THE_DATABASE]
然后，獲得孤兒文件：
postgres=# select * from pg_ls_dir ( '/data/pgdata/11/data/base/75062' ) as file where file ~ '^[0-9]*$' and file::text not in (select oid::text from pg_class );
file
-------
75280
75281
75282
75283
75300
83144
99528
(7 rows)
postgres=#
補(bǔ)充：理解postgreSQL中的prepared transactions和處理孤兒(orphans)事務(wù)
Prepared transactions是PostgreSQL的一個(gè)關(guān)鍵特性。理解該特性提供的功能和處理任何潛在的陷阱對(duì)于系統(tǒng)的維護(hù)是很關(guān)鍵的。所以，我們來深入研究一下具體什么是prepared transactions。
關(guān)于事務(wù)
在數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中，事務(wù)是一種處理通常包含多個(gè)語句的塊中的全部或零個(gè)語句的方法。在提交整個(gè)塊之前，該塊中語句的結(jié)果對(duì)其他事務(wù)不可見。 如果事務(wù)失敗或回滾，則對(duì)數(shù)據(jù)庫完全沒有影響。
事務(wù)依附于會(huì)話。但是，當(dāng)要執(zhí)行與會(huì)話獨(dú)立的事務(wù)時(shí)（也有其他好處）。這就是“prepared transactions”的來源。
prepared transactions
prepared transaction是獨(dú)立于會(huì)話、抗崩潰、狀態(tài)維護(hù)的事務(wù)。事務(wù)的狀態(tài)存儲(chǔ)在磁盤上，這使得數(shù)據(jù)庫服務(wù)器即使在從崩潰中重新啟動(dòng)后也可以恢復(fù)事務(wù)。在對(duì)prepared transaction執(zhí)行回滾或提交操作之前，將一直維護(hù)該事務(wù)。
PostgreSQL文檔聲明，在一個(gè)已存在的事務(wù)塊中，可以使用prepare transaction 'transaction_id‘命令創(chuàng)建一個(gè)prepared transaction。它進(jìn)一步聲明該過程為兩階段提交準(zhǔn)備了一個(gè)事務(wù)。
此外，建議應(yīng)用程序或交互式會(huì)話不要使用prepared transaction。理想情況下，外部事務(wù)管理器應(yīng)該跨同構(gòu)或異構(gòu)數(shù)據(jù)庫資源執(zhí)行原子的全局事務(wù)。
在postgreSQL中，缺省的max_prepared_transaction=0；即關(guān)閉了prepared transaction。如果你想使用prepared transaction，建議將max_prepared_transaction設(shè)置成max_connections的值。在同步的流復(fù)制standby庫上，最好將其設(shè)置的比max_connections大一點(diǎn)，以免standby不能接收查詢。
在任何給定的時(shí)間，你可以查看活躍狀態(tài)的prepared transactions，通過查看視圖pg_prepared_xacts。
pg_prepared_xacts視圖含有以下一些列：
#select * from pg_prepared_xacts;
transaction | gid | prepared | owner | database
-------------+-----+----------+-------+----------
(0 rows)
1.transaction：事務(wù)id
2.gid：用戶為prepared transaction定義的名稱
3.prepared：prepared日期，創(chuàng)建事務(wù)時(shí)帶有時(shí)區(qū)的時(shí)間戳
4.owner：創(chuàng)建該prepared transaction的事務(wù)
5.database：數(shù)據(jù)庫名
創(chuàng)建prepared transaction
知道什么是prepared transaction之后，現(xiàn)在來看看如何創(chuàng)建一個(gè)prepared transaction。創(chuàng)建一個(gè)該事務(wù)通常需要四個(gè)步驟：
1.begin(或start transaction)
2.執(zhí)行需要的操作
3.prepare transaction
4.commit(或rollback prepared)
prepare transaction、commit prepared、或rollback prepared后面加上一個(gè)gid，可以唯一標(biāo)識(shí)prepared transaction。
例如下面的代碼塊：
postgres=# begin;
BEGIN
postgres=# create table abce(id int);
CREATE TABLE
postgres=# insert into abce values(1);
INSERT 0 1
postgres=# prepare transaction 'abce_insert';
PREPARE TRANSACTION
postgres=# select * from pg_prepared_xacts;
transaction | gid | prepared | owner | database
-------------+-------------+-------------------------------+----------+----------
16362 | abce_insert | 2020-12-09 11:41:45.742375+08 | postgres | postgres
(1 row)
postgres=# commit prepared 'abce_insert';
COMMIT PREPARED
postgres=# select * from pg_prepared_xacts;
transaction | gid | prepared | owner | database
-------------+-----+----------+-------+----------
(0 rows)
postgres=#
當(dāng)一個(gè)含有一個(gè)或多個(gè)活躍的prepared transactions的postgresql停止了或者奔潰了，會(huì)為每個(gè)活躍的prepared transaction創(chuàng)建一個(gè)文件，在目錄pg_twophase中。
比如，我們有個(gè)prepared transaction：
postgres=# select * from pg_prepared_xacts;
transaction | gid | prepared | owner | database
-------------+--------------+-------------------------------+----------+----------
16363 | abce_insert2 | 2020-12-09 11:46:01.983483+08 | postgres | postgres
(1 row)
postgres=#
所以我沒有提交事務(wù)就停止了postgresql server。postgresql就會(huì)創(chuàng)建一個(gè)名為00003FEB的文件，對(duì)應(yīng)于prepared transaction的事務(wù)id。
$ ls -l ../data/pg_twophase/
total 4
-rw------- 1 postgres postgres 220 Dec 9 11:47 00003FEB
00003FEB等價(jià)于16363。在postgresql被重啟后，在啟動(dòng)日志會(huì)報(bào)如下信息：
2020-12-09 11:51:28.112 CST [963] LOG: database system was shut down at 2020-12-09 11:47:39 CST
2020-12-09 11:51:28.113 CST [963] LOG: recovering prepared transaction 16363 from shared memory
2020-12-09 11:51:28.132 CST [960] LOG: database system is ready to accept connections
如果你不希望恢復(fù)一個(gè)prepared transaction，可以簡(jiǎn)單地刪除pg_twophase文件夾下的相應(yīng)文件。
這很簡(jiǎn)單，不是嗎?那么我們?yōu)槭裁床唤?jīng)常地使用它呢?畢竟，它提供了更高的提交操作成功的可能性。事情要是這么簡(jiǎn)單就好了!
prepared transaction可能遇到哪些錯(cuò)誤？
如果客戶端消失了，則prepared transaction可以未完成(既不提交也不回滾)。發(fā)生這種情況的原因多種多樣，包括客戶機(jī)崩潰，或者服務(wù)器崩潰導(dǎo)致客戶機(jī)連接被終止而無法重新連接。你實(shí)際上是依靠事務(wù)管理器來確保沒有孤立的prepared transaction。
除了崩潰之外，還有另一種原因可以使prepared transaction未完成。如果一個(gè)用于恢復(fù)的備份包含了事務(wù)的prepared階段，但是沒有包含關(guān)閉事務(wù)的階段，仍然會(huì)生成孤兒事務(wù)。
或者，DBA創(chuàng)建了一個(gè)prepared transaction，卻忘記了關(guān)閉它。
所以，如果一個(gè)prepared transaction沒有完成，又會(huì)有什么大不了的呢?
真正的問題
真正的問題是，孤兒prepared transaction繼續(xù)持有可能包含鎖的關(guān)鍵系統(tǒng)資源，或者使事務(wù)ID保持活動(dòng)狀態(tài)，該事務(wù)ID可能會(huì)阻止vacuum清除只對(duì)該孤兒事務(wù)可見、對(duì)其它事務(wù)不可見的死的元組。
回想一下我在上面創(chuàng)建的prepared 事務(wù)。當(dāng)事務(wù)prepared，并且在提交該事務(wù)之前，如果另一個(gè)事務(wù)試圖更改該表，它將無法獲取所需的鎖并掛起，直到解決了prepared事務(wù)（提交或回滾）為止。 否則，alter命令會(huì)無限期掛起，最終，我必須發(fā)出CTRL + C來停止該命令。
postgres=# select * from pg_prepared_xacts;
transaction | gid | prepared | owner | database
-------------+--------------+-------------------------------+----------+----------
16363 | abce_insert2 | 2020-12-09 11:46:01.983483+08 | postgres | postgres
(1 row)
postgres=# alter table abce add column b int;
^CCancel request sent
ERROR: canceling statement due to user request
postgres=# select c.oid,c.relname,l.locktype,l.relation,l.mode
postgres-# from pg_class c
postgres-# inner join pg_locks l on c.oid=l.relation
postgres-# where c.relname='abce';
oid | relname | locktype | relation | mode
--------+---------+----------+----------+------------------
370883 | abce | relation | 370883 | RowExclusiveLock
(1 row)
postgres=#
對(duì)vacuum的阻塞可能會(huì)更嚴(yán)重，在極端情況下，會(huì)導(dǎo)致數(shù)據(jù)庫關(guān)閉，因?yàn)楣聝簆repared事務(wù)會(huì)阻止事務(wù)id的wrap around。
發(fā)現(xiàn)和通知
雖然一般的預(yù)期是prepared事務(wù)在幾秒鐘內(nèi)完成，但是情況并不總是這樣。一個(gè)prepared事務(wù)可能持續(xù)幾分鐘、幾小時(shí)甚至幾天。
為這些事務(wù)維護(hù)元數(shù)據(jù)本身可能是一項(xiàng)挑戰(zhàn)。但是，我建議設(shè)置一個(gè)術(shù)語來定義prepared事務(wù)可以存在的最大時(shí)間。例如，考慮以下的prepared事務(wù):
postgres=# BEGIN;
BEGIN
postgres=# INSERT INTO abce VALUES(3);
INSERT 0 1
postgres=# PREPARE TRANSACTION 'abce_insert 1m';
PREPARE TRANSACTION
或者下面的事務(wù)：
postgres=# BEGIN;
BEGIN
postgres=# INSERT INTO abce VALUES(4);
INSERT 0 1
postgres=# PREPARE TRANSACTION 'abce_insert 1d';
PREPARE TRANSACTION
在這些事務(wù)名稱中，最后一部分定義事務(wù)的時(shí)間。任何超出時(shí)間的事務(wù)可以通過sql查詢輕易地找出來：
postgres=# select gid,prepared,regexp_replace(gid, '.* ', '') AS age
from pg_prepared_xacts
WHERE prepared + CAST(regexp_replace(gid, '.* ', '') AS INTERVAL) NOW();
gid | prepared | age
----------------+-------------------------------+-----
abce_insert 1m | 2020-12-09 13:39:01.383091+08 | 1m
(1 row)
postgres=#
這里就很清晰地顯示了一個(gè)不應(yīng)該再有效的事務(wù)。因此，使用一個(gè)外部代理或者cron任務(wù)可以輕易找出這些事務(wù)，或者通知管理員、或者回滾事務(wù)。
在我看來，這是一種簡(jiǎn)單而容易的方式，可以確保即使事務(wù)管理器失敗或DBA意外地留下了一個(gè)事務(wù)，也可以在你的環(huán)境中管理孤兒事務(wù)。
結(jié)論
Prepared transactions顯然是一個(gè)非常重要的功能，但是需要使用回退通知程序或清理程序仔細(xì)設(shè)置環(huán)境，以輕松確保這些事務(wù)不會(huì)不必要地占用關(guān)鍵資源，并且系統(tǒng)保持良好狀態(tài)。
PostgreSQL社區(qū)中仍在討論如何處理孤兒prepared事務(wù)。它是否成為postgresql核心的一部分尚待觀察。同時(shí)，我們需要使用外部工具來管理這些事務(wù)，或者設(shè)法解決這個(gè)問題。
以上為個(gè)人經(jīng)驗(yàn)，希望能給大家一個(gè)參考，也希望大家多多支持腳本之家。如有錯(cuò)誤或未考慮完全的地方，望不吝賜教。
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